¡hola!
bueno, yo te recomendaría que usarás los pokemon que te parescan más geniales, los que te gusten más
Aunque como mencionan, puedes usar algún pokemon volador y de agua, que se vuelven útiles conforme avanzas el juego.
oh, pero recuerda, hay pokemon que solo puedes conseguir una vez y si no los atrapas en su momento no podrás obtenerlos a menos que alguien más te los intercambie, esos pokemon son:

(bueno, estos hay dos, pero te recomiendo atrapar al menos uno

)
las aves legendarias (

)

si elegiste a

,

y creo que son todos
Yo te recomiendo atraparlos, aunque no los vayas a entrenar, para que al menos los tengas registrados en el pokedex.
Si tienes más dudas, pregunta
Suerte!