Bueno pues aun asi sea en un computador son emuladores diferentes y no se puede.
Se podria pero entre versiones como esta, Esmeralda, rubi, zafiro, ver joja, rojo fuego, etc
Pero con Pokemon Diamante no se puede, o por lo menos yo no conosco la manera.

de pokemon cristal a cristal en emulador ???

Se puede, bajate de pokemon-stats.com el tgb dual y con eso servira

También puedes intercambiar desde el project64 con el pokémon stadium 2.